ISSN: 1405-888X ISSN-e: 2395-8723
Red de coexpresión de 320 genes de Tectona grandis relacionados con procesos de estrés abiótico y xilogénesis
Vol. 20 Núm. 2 (2017), Artículo original
Vol. 20 Núm. 2 (2017)

Red de coexpresión de 320 genes de Tectona grandis relacionados con procesos de estrés abiótico y xilogénesis

Artículo original
https://doi.org/10.1016/j.recqb.2017.04.001
Publicado 2017-05-18
Vladimir Camel
Instituto de Biotecnología e Ingeniería Genética (IBIG), Facultad de Ciencias Forestales y del Ambiente, Universidad Nacional del Centro del Perú
Esteban Galeano
Centro de Biotecnología Agrícola (CEBTEC), Escola Superior de Agricultura “Luiz de Queiroz”, Universidade de São Paulo
Helaine Carrer
Centro de Biotecnología Agrícola (CEBTEC), Escola Superior de Agricultura “Luiz de Queiroz”, Universidade de São Paulo
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Palabras clave

biología de sistemas
enriquecimiento funcional
genes diferencialmente expresados
minería de literatura
ontología génica

Cómo citar

Camel, V., Galeano, E., & Carrer, H. (2017). Red de coexpresión de 320 genes de Tectona grandis relacionados con procesos de estrés abiótico y xilogénesis. TIP Revista Especializada En Ciencias Químico-Biológicas, 20(2), 5–14. https://doi.org/10.1016/j.recqb.2017.04.001
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Resumen

Tectona grandis es un árbol maderable de importancia económica en bosques tropicales y subtropicales. Mediante este estudio, se identificaron familias de factores de transcripción (FTs) y genes codificantes para enzima, diferencialmente expresados en el xilema del tallo, implicados en la regulación de la respuesta a estrés abiótico y xilogénesis en T. grandis. Así, fue analizada la distribución evolutiva de 19 genes codificantes para FTs de T. grandis mediante análisis filogenéticos. También, fue utilizada la minería de bases de datos y publicaciones para identificar 320 genes de Arabidopsis thaliana (ortólogos a T. grandis) como soporte experimental y predictivo. Como resultados, se encontraron FTs de las familias bZIP, MYB, NAC, ER, bhlh, NuY y genes que codifican enzimas. Así mismo, se logró analizar el interactoma de T. grandis encontrando correlaciones de Pearson significativas para genes que regulan vías metabólicas de fenilpropanoides y estrés abiótico. Además, la red de coexpresión reveló nodos y aristas entre los genes TgRAP1, TgMyB1, TgHSF1, TgMyB3, TgNAC1, TgTsiid1, TgLieTFs1, TgNuy3, TgRAP2 y TgNuy4. En particular, los análisis de ontología génica mostraron 31 genes de respuesta a estrés abiótico, principalmente TgHShT1, TgHSF1 y TgHSF2 como correguladores. Además, se encontró que el regulador maestro TgNAC1, está involucrado en la corregulación de otros factores de transcripción.

 
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